一般说来，自闭症患儿的预后好坏与发现疾病苗头早晚、疾病严重程度、早期言语发育情况、认知功能、是否伴有其它疾病、是否用药、是否训练等多种因素有关。
　
心理学研究发现，自闭症的实质的损害是认知障碍，表现在早期的分享性注意和扮演行为上。分享性注意是指与他人共同分享对某种事物的兴趣，当自闭症面对一种物品时不是与他人分享兴趣，而是要得到它，这种障碍是自闭症的早期症状之一。就象在前面第一部分中讲到的那样，不会进行扮演性游戏也是自闭症的早期表现之一。如果能发现早期症状，进行早期诊断、早期干预和教育无疑会对预后产生积极而有效的影响。　　

自闭症患儿没有独立交往的能力，不会根据环境要求改变自己的行为方式来适应环境，这种障碍随着年龄增大显得更为突出。伴有严重智力低下者，无任何言语功能、无法克制和难以治疗的尖叫、自伤等行为持续存在，直接威胁着生存，给教育和干预带来障碍，作为家长，是很容易辨认出孩子的这些异常的。　

一部分患儿到青春期以后症状可有改善，古怪刻板的行为减少，社会交往和适应社会的能力或多或少地提高。但仍表现为与人交往困难，独来独往，回避他人；在不涉及社交能力时，也能干好某些简单、机械的事情。　

早期或在确诊为自闭症之前已有较好的语言或言语功能者预后较好。尽管疾病本身使他们发展语言的潜能受到限制，但他毕竟是具有这种潜能或基础，使用规范化的语言训练效果比语言或言语功能差的患者效果好。　　

Seatmor等观察到高功能水平自闭症预后较低功能水平为好，他报道16名6岁以下，IQ大于65的自闭症患儿，有半数可完成大学学业，能独立生活。即使是高功能水平自闭症儿童，其业余活动面或活动内容也是有限制的，不会做建设性的决策或提建设性意见。　
　
伴有其它疾病者如严重先天性心脏病、癫痫、肝肾损害、结节性硬化等预后较差，伴有听力受损、特殊生活技能问题者预后较差。
　　
针对某些精神症状给予适当的药物治疗无疑也会影响他们的预后。美国学者Perry等人于1989年将70例自闭症患儿随机分为氟哌啶醇治疗组和安慰剂对照组，在经过6个月的观察后发现，药物治疗组在改善症状和提高功能水平等方面都有显著进步。　

早期训练教育是自闭症得以康复的有效方法之一。其目的在于：改善其社会化行为，首先学会与家庭成员的相处和交往；尽可能多地教他们自理生活的能力，掌握生活实用技能和进一步学习的能力；培养满足职业所需的基本能力；增加对社会生活的了解和探索的兴趣。研究结果显示，经干预后进入成年早期的自闭症患者大约5%不再依赖他人而找到某种有报酬的工作；10%患者症状改善但仍需要保护；25%取得进步但还不能独立生活。McEachin等人在1993年对19例自闭症患者进行了一对一的行为训练，每周训练40个小时，训练长达2年以上。结果显示训练组在IQ、社会适应能力、人际交往、行为和情绪症状、伙伴关系、同情心、家庭关系等方面都有改善，47%可进入普通学校上学。